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方差分析的数据处理和作图

2016-08-07 张浩然 弗雷赛斯

往期回顾:


运用哪一种统计方法需要先确定数据类型,一种是均值,一种是比值,对于后者,那就得运用卡方检验(点这里),而前者运用的是T检验,之前我们讲到单尾T(点这里)和双尾T(点这里)的作图,但是T检验知识针对两列数据的均值比较,那如果数据有多列则如何是好?那么,就要用到今天讲到的方差分析。

单因素方差分析One-Way ANOVA:


t检验适用于两列数据的均值比较。

单因素方差分析适用于两列或更多列数据的均值比较。

但对于两列数据的均值比较,单因素方差分析=等方差假设的双尾t检验。

【实验操作1】One-Way ANOVA


设定4个实验组,每组6只荷瘤裸鼠,总共24只裸鼠。

按组别注射给药(相同剂量和频率),给药15d后解剖出肿瘤,称量瘤重mg如下:
适用的统计方法:

One-Way ANOVA and its post test

单因素方差分析和多重比较


该问题有争议的统计方法:t检验

请按统计学规范来回答如下问题:

①注射该药物或其制剂是否会显著影响瘤重?【该问题的科研意义一般不大】

②在抑制肿瘤方面,研究制剂Liposome是否有效?

③研究制剂是否比市售制剂更有效?研究制剂是否可以作为市售制剂的替代品?

【实例操作2】自由度的理解:


自由度,degree of freedom,缩写df


自由度越高,下结论越有把握。

对于刚才那个有争议的问题,ANOVA的自由度比t检验更高。


争议:使用方差分析还是t检验?



我只对研究制剂和市售制剂感兴趣,只想比较这两个关键组。

是用方差分析后多重比较?

还是直接对两列进行t检验?

浩然的观点:推荐使用方差分析,不排斥使用t检验,随机应变。但在论文中标注显著性差异时要标上统计方法。


ANOVA和T检验都涉及了方差齐性假设,虽然可以Bartlett’s test或Levene’s test来衡量方差齐性(数据量小仅供参考),但多数时候方差齐性假设是经验性的。

方差分析:使用高风险的假设获得高收益

T检验:使用低风险的假设获得低收益

显著性差异是针对某一统计方法的:


统计学的精髓在于:在处理同类问题时,不同工作者都采用相同的统计分析方法。论文中标注显著性差异时,要标上所使用的统计分析方法。

“Statistically significant” is not the same as “scientifically important”.

我是教统计的,但我不迷信统计,我希望我的学生也不迷信统计。——我的统计学老师安老师是这么说的。

“statistically significant”不等于 “scientifically important”


1、scientifically unimportant


使用等方差假设的双尾t检验

P<0.0001<0.05,有显著性差异

statistically significant

但提升幅度仅有1%

scientifically unimportant (Trivial)


2、scientifically important


使用等方差假设的双尾t检验

P<0.0001<0.05,有显著性差异

statistically significant

但提升幅度高达200%

scientifically important

方差分析的所有类型:



GraphPad方差分析的学习方法:


单因素方差分析

欢迎对话框→Column→Use sample data→One-way ANOVA

双因素方差分析

欢迎对话框→Grouped→Use sample data→Two-way ANOVA

Sample data的黄色备注标签里有链接,点击后有更详细的介绍。


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浩然专栏
张浩然,男,北京大学药学博士,创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。等不及想看四部曲?给我们发送H002,打包给你哦。





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